Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tubb1A2AQ07 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tubb1A2AQ07 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tubb1A2AQ07 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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