Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttll9A2APC3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ttll9A2APC3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms