Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Shisal2aA2A9G7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms