Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef6A2A8M8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms