Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms