Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Top3bQ9Z321 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Top3bQ9Z321 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Top3bQ9Z321 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Top3bQ9Z321 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top3bQ9Z321 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Top3bQ9Z321 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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