Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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