Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Limd1Q9QXD8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms