Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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