Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tlr5Q9JLF7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlr5Q9JLF7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms