Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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