Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkc1Q9ESX5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms