Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samd8Q9DA37 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Samd8Q9DA37 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms