Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T2

Gsdmdc1, Gasdermin-D, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmdc1Q9D8T2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsdmdc1Q9D8T2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms