Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alkbh4Q9D8F1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh4Q9D8F1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms