Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms