Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf2lQ9D478 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms