Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms