Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhobtb3Q9CTN4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms