Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms