Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms