Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl11Q9CQF0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms