Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CQC3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQC3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQC3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQC3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQC3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQC3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQC3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQC3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQC3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQC3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQC3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms