Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms