Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms