Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mrpl3Q99N95 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mrpl3Q99N95 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl3Q99N95 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl3Q99N95 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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