Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.8 ms