Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ms4a4dQ99N05 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms