Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gins4Q99LZ3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms