Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms