Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms