Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms