Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms