Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpsap2Q8R574 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap2Q8R574 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap2Q8R574 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap2Q8R574 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpsap2Q8R574 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms