Protein–RNA interactions for Protein: Q8R307

Vps18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps18Q8R307 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps18Q8R307 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms