Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf183Q8QZS5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms