Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms