Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trip10Q8CJ53 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms