Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LgsnQ8CIX8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LgsnQ8CIX8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LgsnQ8CIX8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LgsnQ8CIX8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LgsnQ8CIX8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LgsnQ8CIX8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LgsnQ8CIX8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LgsnQ8CIX8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms