Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Csnka2ipQ8CH19 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Csnka2ipQ8CH19 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Csnka2ipQ8CH19 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Csnka2ipQ8CH19 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Csnka2ipQ8CH19 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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