Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ercc8Q8CFD5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ercc8Q8CFD5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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