Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ccdc113Q8C5T8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc113Q8C5T8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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