Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms