Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp5Q8BX09 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms