Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp38Q8BW70 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp38Q8BW70 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp38Q8BW70 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp38Q8BW70 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp38Q8BW70 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp38Q8BW70 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Usp38Q8BW70 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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