Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cdca8Q8BHX3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca8Q8BHX3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms