Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34b3Q80ZS5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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