Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbsnQ80Y56 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbsnQ80Y56 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms