Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mindy1Q76LS9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms