Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Syne1Q6ZWR6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Syne1Q6ZWR6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Syne1Q6ZWR6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Syne1Q6ZWR6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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